سعيا لزيادة كفاءة الأداء وجودة الخدمات التي يقدمها المركز تشخيصية كانت أم بحثية فقد اهتم بتطبيق وأتباع أعلى معايير الجودة العالمية. منذ الحصول على شهادة ISO 9001/2008 في نيسان 2011، سار المركز عدة خطوات في مجال ضبط جودة الخدمات حيث تم الانخراط بدراسات المشاركة و الكفاءة العالمية مع المركز الأمريكي للسيطرة على الأمراض والوقاية منهاCDC والان يعمل على تطبيق متطلبات ومعايير الاعتمادية الأمريكية العالمية College of American Pathologists (CAP) والمتوقع الحصول عليها قريبا. كما أن العامليين في المركز مدربين بشكل جيد في مجال السلامة الأحيائية والأمن البيولوجي.
يعقد في المركز اجتماعات دورية لمناقشة ومراجعة تقارير التدقيق الداخلي وتقييم الأداء وأنشطة المركز ووضع الخطط المستقبلية.
قسم ضبط الجودة أضاف الى المركز عدة أشياء مفيدة: من خلال تنظيم العمل, تحديد الأدوار والمسؤوليات, التقليل من التكاليف وضياع المواد, توفير الجهد ورفع جودة الخدمات من خلال تطبيق معايير الجودة المحلية والعالمية وتأكيد جودة الخدمات التشخيصية المقدمة بالتعاون مع مئات المختبرات حول العالم.
شهادة ISO 9001/2008 وظفت لتحقيق أهداف تنظيمية وادارية وساعدت هذه الشهادة على بناء الأساس لتطوير وتحسين وتعزيز الأداء وتحقيق توقعات ورضاء العملاء ، والتعامل بجدية مع الملاحظات والشكاوى. أما شهادة College of American Pathologists (CAP) فالمركز من خلالها يسعى لتحقيق أهداف فنية وعملية والتعامل بعمق مع الفحوصات والخدمات المقدمة حيث يكون العامليين قادرين على اصدار تقارير الفحص والتشخيص للمرضى بدقة وثقة عالية باتباع الاجراءات المعيارية للتحليل واستخدام أجهزة مصانة ومعايرة والكادر حاصل على التدريب المطلوب لرفع الخبرة والمعرفة ومواكبة التطور في طرق التحليل السليمة.