في البدايه تم تأسيس قسم  علم وظائف الاعضاءفي كليه الطب في جامعه العلوم والتكنولوجيا الاردنيه عام 1998 كقسم منفصل ومن ثم تم دمجه مع قسم الكيمياء الحيويه والبيولوجيا الجزيئيه .ويقوم القسم بتقديم القواعد الاساسيه لطلاب الطب وطلاب العلوم الطبيه المسانده  لفهم نظام أعظام الجسم من الناحيه الخلويه والعضويه وايضا يبحث في كيفيه توزيع أليه هذا التماثل العضوي الذي يؤدي الى تطور المرض .وللوصول الى الاهداف التعليميه ‚يوفر القسم المساقات  لطلاب البكالوريس والماجستير في التخصصات التاليه :علم وظائف الاعضاء,والكيمياءالحيويه وهندسه الجينات والبيولوجيا الجزيئيه.

وفي العام الدراسي 2003-2004 أسس القسم ونفذ برنامجين جدد.البرنامج الاول للحصول على درجه الماجستير في علم وظائفالاعضاء  والبرنامج الثاني للحصول على درجه الماجستير في الكيمياء الحيويه والوراثه الجزيئيه ,كما ان الطلاب المسجلين في  هذه البرامج بحاجه الى تخطي 25 ساعه تدريبيه بالاضافه الى 9 ساعات رساله.

ويقوم الكادر التدريسي باعمال بحثيه في مجال فسيولوجيا الجهاز الهضمي والقلب وهندسه الجينات للأمراض المزمنه مثل السمنه والسكري والسرطان.

الابحاث في القسم تشمل الجزئين الاساسي والمتعلقه بالطبيعه ويتم استخدام الخلايا من خلال نظام التجارب المخبريه .وكما ان الابحاث في القسم يتم تمويلهابشكل اساسي من قبل عماده البحث العلمي في جامعه العلوم والتكنولوجيا الاردنيه.​