تتوافق اهداف القسم مع اهداف كلية الطب البيطري:
تقديم خدمات تعليمية وبحثية عالية الجودة في المجالات الطبية والتكنولوجية والتطبيقية لصناعة ونشر المعرفة وقيادة المجتمعات الإنسانية وتنميتها وخلق بيئة تكنولوجية وعلمية محفزة للتميز والابداع والابتكار من خلال شراكات محلية وعالمية فاعلة.
- المحافظة على معايير عالية المستوى خاصة بتدريب طلبة البكالوريوس والدراسات العليا.
- اعتماد مختبرات الكلية كمختبر وطني مرجعي لتشخيص امراض الحيوان
- اعتبار الكلية مركزا علميا لتقديم الحلول للمشاكل الصحية المتعلقة بالحيوان.
- القيام بالواجبات التعليمية والبحثية في مجالات صحة وانتاج القطيع والامور الاخرى المتعلقة بالصحة العامة مثل سلامة الغذاء والانتاج الحيواني.