جاءت فكرة تأسيس مختبر التكنولوجيا الحيوية في الأردن حيث  بدأ كل شيء في عام 1998 عندما قدم فريق من أعضاء هيئة التدريس اقتراح للبنك الدولي من أجل دعم برامج البحوث في مجال التكنولوجيا الحيوية، ولتدريب طلاب الدراسات العليا وطلاب الجامعية مجال تخصاصاتهم . حيث  هذه المنحة  التي تم الحصول عليها من البنك الدولي لتزويد المختبرات بالمعدات التقنية الحيوية الحديثة  .

في 6 مارس 2003، تم تأسيس مركز التكنولوجيا الحيوية في الجامعة  ومقرة في  مستشفى الملك عبد الله المؤسس الجامعي وفي عام 2005، تم دمج المركز إلى الأميرة هيا مركز التكنولوجيا الحيوية (PHBC)، بما يتناسب مع المرسوم رقم 998/2005 الصادر عن مجلس التعليم العالي في 10 مارس 2005.